Это можно сделать с помощью оператора языка запросов ССЫЛКА, который позволяет проверить, является ли значение выражения, указанного слева от него, ссылкой на таблицу, указанную справа. Рассмотрим на примере, выберем из регистра накопления РеализацияУслуг только те записи, для которых регистратором является документ РеализацияТоваровУслуг:

Запрос=Новый Запрос("
|ВЫБРАТЬ
| РеализацияУслуг.Регистратор,
| РеализацияУслуг.Сумма
|ИЗ
| РегистрНакопления.РеализацияУслуг КАК РеализацияУслуг
|ГДЕ
| Регистратор ССЫЛКА Документ.РеализацияТоваровУслуг");

По материалам сайта: http://www.coder1cv8.narod.ru/Publication4.html