Используя метаданные и возможность объединения запросов:

Запрос=Новый Запрос;
Текст="";
Для Каждого Документ Из Метаданные.Документы Цикл
Текст=Текст+"ВЫБРАТЬ Ссылка ИЗ Документ."+Документ.Имя+" ОБЪЕДИНИТЬ ";
КонецЦикла;
Запрос.Текст=Лев(Текст,СтрДлина(Текст)-СтрДлина(" ОБЪЕДИНИТЬ "));
Выборка=Запрос.Выполнить().Выбрать();

По материалам сайта: http://www.coder1cv8.narod.ru/Publication4.html